Bien ya he solucionado el problema
Me dijeron en Clickteam que el problema son las extensiones BlackJack y Shake
y efectivamente una vez retiradas compila bien
El exportador IOS en Ios Xcode project al parecer pilla todas las extensiones de iphone aunque no las utilices, esto se hace para que luego si actualizas el proyecto lo hagas con la opción de archivos cci y así no tienes que reemplazar el proyecto por otro nuevo, tan sólo compilarlo de nuevo.
Cuando ya se tiene la aplicación testeada y terminada, se utiliza Final Xcode project, para crear el proyecto sólo con las extensiones utilizadas.